手术治疗：是本病的首选治疗方法。术前均应行乳导管造影检查，以明确病变的性质及定位。术后宜做石蜡切片检查，因为冰冻切片检查在辨别乳腺导管内乳头状瘤和乳头状癌时最困难，两者常易发生混淆，故不宜以冰冻切片表现为恶性依据而行乳房根治术。
如果为单发的乳腺导管内乳头状瘤，手术时将病变的导管系统切除即可；如果为多发的乳腺导管内乳头状瘤，因其较易发生恶变，则宜行乳腺区段切除，即将病变导管及其周围的乳腺组织一并切除。对于那些年龄在岁以上者，造影显示为多发的乳腺导管内乳头状瘤，或经病理检查发现有导管上皮增生活跃甚至已有上皮不典型性改变者，则宜行乳房单纯切除，以防生变。
中医中药治疗：因乳腺导管内乳头状瘤多以乳头溢液为主要症状，故中医称之为“乳衄”。一般认为乳衄多为肝郁火旺或脾虚血亏引起，故治疗应以疏肝解郁、清泄肝火及益气健脾、养血摄血为法。山栀，柴胡，当归，赤芍，橘叶，川楝子，制香附，夏枯草，侧柏炭，藕节炭，生甘草。党参，白术，茯苓，当归，白芍，龙眼肉，远志，藕节炭，炙甘草。
